DNA序列反向互补工具--php tool

这两天看了些php的应用,发现php网络应用真是方便...根据前几章关于string的知识写个生物小应用复习下. 以前总是利用网上的dna反向互补工具,但是有时候不能连接,后来用了sms,非常方便,支持下载到本地使用.自己用用php也不错, 练习练习代码.主要实现以下功能: 1.反向互补.... 2.去除多余字段(数字,空格,主要ncbi上下来的序列多含有数字和空格) 3.提示含有非碱基字符,有些时候SNP的出现需要保留未实现功能: 本来想在原始序列中突出显示非碱基字母,比如红色显示,结果没有成功....substr_replace()无法应用在上面...暂时看到的知识想不出其他解决方案了,先等等吧,下次会了再改,反正问题不大.演示: DNA rev-complement tool 代码:(有点乱,有些地方觉得能简洁,但似乎没有找到可行的简洁之法,主要是去除序列中数字那段,后来发现ereg_replace()能实现,方便多了)

求知·生命 · 2009-07-15 · 703 人浏览
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