一个启动子终止子预测工具集合站


上次介绍了一款启动子预测工具,今天偶尔看到一个网站收录了好几个这方面的在线工具,包括原核和真核的启动子及终止子分析.也包括上次介绍的NNPP

除了列出了工具的网址,还有简单介绍和相关的参考文献,方便对于工具的可信度和对比性进行进一步分析,不过仍然没有专门针对植物方面的.

PROMOTERS & TERMINATORS

Neural Network Promoter Prediction 
(Berkeley Drosophila Genome Project, U.S.A.)(Reference: M.G. Reese 2001. Comput. Chem. 26: 51-6).
 
Promoter 2.0 Prediction Server 
(S. Knudsen,Center for Biological Sequence Analysis, Technical University of Denmark)
 - predicts transcription start sites of vertebrate Pol II promoters in DNA sequences