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DNA 序列反向互补工具 php tool

这两天看了些 php 的应用, 发现 php 网络应用真是方便… 根据前几章关于 string 的知识写个生物小应用复习下. 以前总是利用网上的 dna 反向互补工具, 但是有时候不能连接, 后来用了 sms, 非常方便, 支持下载到本地使用. 自己用用 php 也不错, 练习练习代码. 主要实现以下功能: 1. 反向互补 2. 去除多余字段 (数字, 空格, 主要 NCBI 上下来的序列多含有数字和空格)3. 提示含有非碱基字符, 有些时候 SNP 的出现需要保留
Rice Atlas Database — 一个水稻表达图表数据库

Rice Atlas Database — 一个水稻表达图表数据库

上周文献报告听到一个数据库 riceatlasdatabase, 感觉不错, 文献发在 naturegenetics, 主要是通过大量生物芯片得到数据. 会后查了一下, 看看一些基因表达有没有收录在里面作为参考. 进入首页后, 我就直奔 searchdatabase, 不过进去后发现一头雾水, 不知道该输入什么, 随便输了 2 个关键词和序列, 都找不到. 后来经过一个师弟提醒, 尝试使用国际基因名, 搜到了…. 后来发现还支持 Oligo

一个启动子终止子预测工具集合站

上次介绍了一款启动子预测工具, 今天偶尔看到一个网站收录了好几个这方面的在线工具, 包括原核和真核的启动子及终止子分析. 也包括上次介绍的 NNPP 除了列出了工具的网址, 还有简单介绍和相关的参考文献, 方便对于工具的可信度和对比性进行进一步分析, 不过仍然没有专门针对植物方面的. PROMOTERS&TERMINATORSNeuralNetworkPromoterPrediction(BerkeleyDrosop